堆垛机在运行中可能会出现多种问题，以下是一些常见的问题及其解决方案：
水平变频器故障：由于过载、减速过快等原因，堆垛机速度减慢或者停止。解决方法是将堆垛机开回原点，处于空载、停准状态，然后复位。
水平停不准：在规定时间或次数内未点动到停准位置。偶尔出现可复位后继续运行，连续出现需检查水平电机抱闸或轨道。
水平编码异常：水平编码器读数不正确。偶尔出现可复位后继续运行，连续出现需检查编码器是否松动，检查完毕后重新示数。
水平示教失败：示教时到达前端时的列数与给定的最大列不一致。重现示教或检查给定列数是否正确。
前/后认址器故障、前/后限速开关故障或前/后开关故障：检查线路、认址片、更换开关；检查线路、拆光板或更换开关，同时检查堆垛机的编码器。
水平运行反向：水平冲编码器脉冲值的方向与给定的运动信号的方向相反。
堆垛机在持续运动中，其内置的机械模块会出现一些问题，如作业过程中堆垛机的一些核心会出现剧烈振动；堆垛机地轨、行走轮与导向轮磨损严重，进而干扰驱动机构的电流稳定，进而发生行走变频情况而触发报警装置；持续作业中货叉伸缩系统容易出现故障，会出现传送带卡死、抱死的情况。
堆垛机运行中突然掉电：超速保护钢丝绳断绳开关动作，调整行程开关与撞尺间隙，收紧钢丝绳；过载保护开关动作，调整行程开关与撞尺间隙；集电器与滑触线接触处破损引起短路，更换集电器；集电器瞬间断电，更换集电器或检查滑触线接头；滑触线接头螺栓松动，检查紧固滑触线接头。
